研究报告

榴莲 PEPC基因家族全基因组鉴定及表达分析  

彭文丽1 , 杨成坤3 , 崔志富1 , 赵成志3 , 王红2*
1海南省农垦科学院,海口, 570311; 2温州市农业科学研究院,温州, 325006; 3海南大学园艺学院,热带作物新品种选育教育部工程研究中心,海口, 570228
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2022 年, 第 20 卷, 第 9 篇   
收稿日期: 2021年04月02日    接受日期: 2021年04月09日    发表日期: 2022年07月18日
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摘要

本研究从榴莲全基因组中鉴定榴莲PEPC 基因,并分析了它们在‘猫山王’榴莲不同组织(叶和果肉)3个不同品种(‘猫山王’  ,‘金枕头’和‘普玛尼’)果肉中的表达情况。结果共获得 6个榴莲 DzPEPC家族成员,其蛋白理化特征较为相似,且所有榴莲 PEPC蛋白亚细胞定位预测均可能存在于细胞质中。染色体定位显示榴莲PEPC 位于 5条不同的染色体。联合榴莲、水稻、菠萝、拟南芥的 PEPC蛋白共同进行系统进化分析,结果显示共可分为 2个亚组,DzPEPC1DzPEPC3DzPEPC4DzPEPC5PTPC亚族(植物型)DzPEPC2DzPEPC6BTPC亚族(细菌型),且发现榴莲 PTBCBTPC分离时间早于单子叶植物和双子叶植物的分离时间,两者基因结构和蛋白序列差异大,但仍具有一定的保守性。顺式作用元件分析显示,DzPEPC 含有数量较多的光响应元件和激素响应元件。转录组表达分析发现,DzPEPCs 在不同榴莲组织中的表达具有偏好性,可能参与榴莲的多个生物学过程(包含光合和非光合过程),并初步推测DzPEPC4 与榴莲果肉发育过程相关。本研究可为进一步探究DzPEPC 家族在榴莲中的生物学功能提供参考。

关键词
榴莲;PEPC基因家族;表达分析

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《分子植物育种》印刷版
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